Dit museum vindt u op het zogenaamde Museumeiland, samen met het Atlas Museum, de Alte Nationalgalerie en het Bodemuseum. Het complex bevat eigenlijk drie verschillende musea: een verzameling Antieken, een Voor-Aziatisch museum en een Islamitisch museum.
Het Pergamonmuseum werd gebouwd in 1930 rondom het altaar van Pergamon. Dit altaar maakte deel uit van een aan Zeus gewijde tempel (180-160 v.Chr.) in Klein-Azië.
Behalve kostbare mozaïeken vindt u de Romeinse marktpoort van Milete (Turkije), de met prachtig geglazuurde bakstenen geplaveide processieweg van Babylon met de Ischtarpoort en tal van kunstvoorwerpen en objecten uit de vierduizend jaar oude geschiedenis, cultuur en kunst van Voor-Azië.
Het islamitisch museum geeft een mooi overzicht van de ontwikkeling van de islamitische kunst met o.a. de pronkgevel van het Omayadische woestijnkasteel uit het midden van de 8e eeuw.