Het 'Geiteneiland' (Tragurium) werd het door de Romeinen genoemd. De Griekse stichters kwamen van het eiland Issa, het huidige eiland Vis, in de 3e eeuw v.Chr. Trogir bevolken omdat de grond, het klimaat en de ligging beter waren. Bovendien was de stad gemakkelijk te beschermen. Het was oorspronkelijk een schiereiland maar omdat de Grieken een kanaal groeven kwam het los van het vasteland. De Romeinen stuurden er het 'schuim der natie' naar toe en gebruikten het als verbanningsoord. In de middeleeuwen werden er lange tijd ook zieken en melaatsen naar toe gezonden.
De oude binnenstad heeft de sporen van Griekse, Romeinse en Turkse invloeden. In de 15e eeuw kwam het onder Venetiaans bestuur en beleefde het zijn bloeitijd. De kathedraal Sv. Lovro heeft een fraai Romaans portaal uit 1240. Naast de kerk ligt het Opcinska Palaca uit de 14e eeuw en tegenover de kerk een klokkentoren die van onder Romaans en in het midden gotisch is, en een renaissancistische top heeft. Een wonderlijke mengeling waar men dan ook eeuwen over gedaan heeft. Trogirs binnenstad heeft iets weg van een openluchtmuseum, de smalle kronkelende vaak overdekte steegjes met eeuwenoude gladde keien en bebouwd met gotische of Renaissancehuizen en palazzo's. De middeleeuwen komen tot leven in Trogir en dus is het geen wonder dat ook dit juweel in 1997 op de werelderfgoedlijst van Unesco is geplaatst.